Som konsekvens af resultatet af valget til Grønlands Landsting i november 2005, har Landsstyreformand Hans Enoksen og Statsminister Anders Fogh Rasmussen valgt Jonathan Motzfeldt som ny formand for Grønlands-dansk Selvstyrekommission. Jonathan Motzfeldt, som er Vestnordisk råds første næstformand, har været medlem af selvstyrekommissionen siden dens nedsættelse.
Landsstyreformanden og statsministeren er enige om, at det nye formandskab bestående af Landtingets formand, Jonathan Motzfeldt og Folketingets formand, Christian Mejdahl udgør det bedst mulige grundlag for færdiggørelsen af kommissionens arbejde.
Der er i øvrigt sket en udskiftning af to af de grønlandske medlemmer i selvstyrekommissionen, idet Johan Lund Olsen, Inuit Ataqatigiit, og Ruth Heilmann, Siumut, er blevet medlemmer i stedet for Aqqaluk Lynge og Per Rosing-Petersen.